AlanineDipeptide: ala2.i

File ala2.i, 1.3 KB (added by fgygi, at 2016-10-24T20:49:53Z)

Unit cell definition and atomic positions for ground state calculation

Line 
1# Ala2
2set cell 25 0 0  0 25 0  0 0 25
3species carbon    C_ONCV_PBE-1.0.xml
4species nitrogen  N_ONCV_PBE-1.0.xml
5species oxygen    O_ONCV_PBE-1.0.xml
6species hydrogen  H_ONCV_PBE-1.0.xml
7atom C1 carbon    -6.579400    -3.078900     0.423100
8atom C2 carbon    -4.511500    -1.253100    -0.225200
9atom H1 hydrogen  -8.413100    -2.443100    -0.377900
10atom H2 hydrogen  -6.765500    -3.219500     2.507900
11atom H3 hydrogen  -6.120300    -4.970600    -0.359000
12atom O1 oxygen    -5.005800     0.613000    -1.495200
13atom N1 nitrogen  -2.104100    -1.704800     0.574900
14atom C3 carbon     0.000000     0.000000     0.000000
15atom H4 hydrogen  -1.779900    -3.342200     1.579200
16atom C4 carbon    -0.381900     2.556000     1.339600
17atom H5 hydrogen  -2.167500     3.479100     0.756300
18atom H6 hydrogen   1.166700     3.891900     0.879600
19atom H7 hydrogen  -0.430800     2.277300     3.420300
20atom C5 carbon     2.546000    -1.110900     0.778300
21atom H8 hydrogen   0.070900     0.285900    -2.081500
22atom O2 oxygen     2.640700    -3.138700     1.886300
23atom N2 nitrogen   4.721200     0.150600     0.206800
24atom C6 carbon     7.208000    -0.783700     0.879500
25atom H9 hydrogen   4.620700     1.839000    -0.758500
26atom H10 hydrogen  7.139400    -2.611600     1.907100
27atom H11 hydrogen  8.167200     0.623300     2.104200
28atom H12 hydrogen  8.342700    -1.050000    -0.864300